Общие водные ресурсы рек в средний по водности год составляют 100,5 км3, из которых только 56,5 км3 формируются на территории республики, остальной объем 44,0 км3 поступает из сопредельных государств: Китайской Народной Республики – 18,9 км3, Республики Узбекистан – 14,6 км3; Кыргызской Республики – 3,0 км3; Российской Федерации – 7,5 км3 /62/. Современные оценки ресурсов речного стока Казахстана существенно отличаются от ранее выполненных оценок. Так, в работах Российского Государственного гидрологического института двадцатилетней давности среднемноголетний речной сток республики оценивался в объеме 126,0 км3/ год, из которых 66,8 км3/год составлял местный сток и 59,8 км3/год — трансграничный. Таким образом, ресурсы речного стока в последнее двадцатилетие уменьшились на 25,3 км3/год, в т.ч. местный сток — на 10,3 км3/год, трансграничный на 15,2 км3/год. Причинами нестабильности речного стока принято считать глобальные и региональные изменения климата, а также хозяйственную деятельность на водосборах и в речных долинах, в т.ч. на территориях сопредельных государств. Ресурсы речного стока республики характеризуются значительной изменчивостью по годам. Наблюдаемые максимальные и минимальные значения годового стока соответственно в 3 раза больше и в 2 раза меньше нормы. Речному стоку свойственно также чередование маловодных (по 5-7 лет) и многоводных (по 1-3 года) периодов . В силу климатических особенностей республики до 90 % годового объема стока степных рек приходится на весенний период и до 70 % стока горных рек – на летний. В средний по водности год объем водных ресурсов Республики Казахстан оценивается в 100,5 км3. Вместе с тем, располагаемый объем для хозяйственного использования, составляет всего 46 км3, поскольку значительные объемы воды затрачиваются на экологические, рыбохозяйственные, транспортные и энергетические нужды, санитарные попуски в нижние бъефы ГЭС, фильтрационные и другие виды потерь. В частности, около 29 км3 в год составляет суммарный объем обязательных попусков воды для удовлетворения экологических и санитарных требований по рекам Сырдарья, Урал, Или, Тобол, Иртыш, Ишим, Тургай, Чу. Транспортно-энергетические затраты стока по Иртышу вместе с долей Российской Федерации составляют 8,7 км3, а потери на испарение и фильтрацию в водохранилищах и руслах рек оцениваются в 12 км3 в год. Весенний половодный сток равнинных рек Центрального Казахстана, который рассеивается из-за невозможности регулирования и использования, составляет около 4,8 км3. В маловодные годы общий объем речного стока снижается до 58 км3 , а располагаемый для хозяйственного использования — до 26 км3 в год. Общепринятыми показателями водообеспеченности регионов принято считать удельные годовые объемы стока, приходящиеся на единицу территории и одного жителя. Удельная водообеспеченность Республики Казахстан составляет 37 тыс. м3 на 1 км2 и 6,0 тыс. м3 на одного человека в год. Это один из самых низких показателей среди стран CНГ. При этом ситуация с обеспеченностью водой в республике существенно различается: есть вполне водообеспеченные регионы, например, бассейн реки Иртыш (Восточно-Казахстанская область), и есть регионы, где вода является дефицитом, например, Мангистауская область. Сопоставление водных ресурсов в годы разной водности с потребностью экономики Казахстана показывает наличие острого дефицита воды как по отдельным регионам, так и в целом по республике. Дефицит водных ресурсов в Республике Казахстан в средние по водности годы достигает 6,6 км3 и ощущается во всех бассейнах. В засушливые годы уровень водообеспечения составляет 60%, а по отдельным регионам (Центральный Казахстан) всего 5-10%, при этом дефицит приходится, в основном, на орошаемое земледелие. Причинами дефицита водных ресурсов являются природные факторы (неравномерность распределения поверхностных вод по территории республики, значительные временные колебания стока рек по годам и сезонам ), значительный объем использования стока трансграничных рек сопредельными государствами, чрезмерное безвозвратное водопотребление на орошение и потери воды в республике, а также низкое качество воды влияет на то, что доступные водные ресурсы могут быть использованы лишь частично.